booltБюллетень Государственного Никитского ботанического садаBulletin of the State Nikitsky Botanical Gardens0513-1634Federal State Funded Institution of Science “The Labour Red Banner Order Nikitsky Botanical Gardens – National scientific Center of the RAS”10.25684/NBG.boolt.130.2019.13boolt-181Research ArticleЮЖНОЕ ПЛОДОВОДСТВОSOUTHERN HORTICULTUREИСПОЛЬЗОВАНИЕ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ДЛЯ ДНК - ПАСПОРТИЗАЦИИ И ИЗУЧЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ВЗАИМОСВЯЗЕЙ СОРТОВ ПЕРСИКА, БЛИЗКИХ ПО ПРОИСХОЖДЕНИЮUse of microsatellite markers for DNA passportization and study of genetic relations of cultivars of peach that are similar in originСупрунИван ИвановичSuprunI. I.noemail@neicon.ruСмыковАнатолий ВладимировичSmykovA. V.fruit_culture@mail.ruСтепановИлья ВладимировичStepanovI. V.noemail@neicon.ruФедеральное государственное бюджетное научное учреждение «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»Russian FederationНикитский ботанический сад - Национальный научный центр РАНRussian Federation201919082019013099107Copyright © Супрун И.И., Смыков А.В., Степанов И.В., 20192019Супрун И.И., Смыков А.В., Степанов И.В.Suprun I.I., Smykov A.V., Stepanov I.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://boolt.elpub.ru/jour/article/view/181

Приведены результаты анализа полиморфизма 18 микросателлитных маркеров на выборке из 19 сортов персика, включающей несколько групп сортов, близких по происхождению. Маркеры показали уровень полиморфизма от 2 (маркеры BPPCT028 и UDP98-409) до 7 аллелей (маркер EMPaS01) на локус. Аллельный набор по трем наиболее полиморфным маркерам сформировал уникальные фингерпринты для каждого из изученных сортов, несмотря на общность по происхождению для многих сортов. Результаты кластерного анализа выявили закономерности при распределении по кластерам, согласующиеся с происхождением сортов.

The results of polymorphism analyze of 18 microsatellite markers on samples of 19 peach cultivars, including several groups of cultivars of similar origin, are presented. The markers have shown the level of polymorphism from 2 (BPPCT028 and UDP98-409 markers) to 7 alleles (EMPaS01 markers) per locus. Allele set of three most polymorphic markers formed unique fingerprints for each of the studied cultivars, despite the common origin for many cultivars. The results of cluster analysis revealed patterns in the distribution of clusters, consistent with the origin of cultivars.

персикгенофондмикросателлитные ДНК-маркерыполиморфизмReferencesПлугатарь Ю.В., Бабина Р.Д., Супрун И.И., Науменко Т.С., Алексеев Я.И. Оценка сортов груши, выделенных из генофондовой коллекции Никитского ботанического сада по комплексу хозяйственно ценных признаков, с помощью микросателлитных маркеров // Вавиловский журнал генетики и селекции - 2018. - 22 (1) - С. 60-68 DOI 10.18699 / VJ 18.332/.Плугатарь Ю.В., Бабина Р.Д., Супрун И.И., Науменко Т.С., Алексеев Я.И. Оценка сортов груши, выделенных из генофондовой коллекции Никитского ботанического сада по комплексу хозяйственно ценных признаков, с помощью микросателлитных маркеров // Вавиловский журнал генетики и селекции - 2018. - 22 (1) - С. 60-68 DOI 10.18699 / VJ 18.332/.Смыков А.В., Федорова О.С., Шишова Т.В., Иващенко Ю.А. Селекция персика и ее результаты в Никитском ботаническом саду // Сборник научных трудов ГНБС. - 2015. - Т. 140. - С. 23 - 33.Смыков А.В., Федорова О.С., Шишова Т.В., Иващенко Ю.А. Селекция персика и ее результаты в Никитском ботаническом саду // Сборник научных трудов ГНБС. - 2015. - Т. 140. - С. 23 - 33.Супрун И.И., Смыков А.В., Токмаков С.В. SSR-фингерпринтинг и оценка генетических взаимосвязей сортов персика современной селекции Никитского ботанического сада // Садоводство и виноградарство. - 2017. - № 5. - С. 23 - 27.Супрун И.И., Смыков А.В., Токмаков С.В. SSR-фингерпринтинг и оценка генетических взаимосвязей сортов персика современной селекции Никитского ботанического сада // Садоводство и виноградарство. - 2017. - № 5. - С. 23 - 27.Супрун И.И., Токмаков С.В., Степанов И.В., Балапанов И.М. Разработка мультиплексных наборов SSR-маркеров для использования в изучении генетического разнообразия в пределах родов Malus, Prunus и Pyrus // Научные труды ГНУ СКЗНИИСиВ «Методологическое обеспечение селекции садовых культур и винограда на современном этапе», 2013. - Т. 1. - С. 97 - 101.Супрун И.И., Токмаков С.В., Степанов И.В., Балапанов И.М. Разработка мультиплексных наборов SSR-маркеров для использования в изучении генетического разнообразия в пределах родов Malus, Prunus и Pyrus // Научные труды ГНУ СКЗНИИСиВ «Методологическое обеспечение селекции садовых культур и винограда на современном этапе», 2013. - Т. 1. - С. 97 - 101.Aranzana M.J., Carbó J., Arús P. Microsatellite variability in peach (Prunus persica (L.) Batsch): cultivar identification marker mutation pedigree inferences and population structure // Theor Appl Genet. - 2003. - V. 106. - P. 1341 - 1352.Aranzana M.J., Carbó J., Arús P. Microsatellite variability in peach (Prunus persica (L.) Batsch): cultivar identification marker mutation pedigree inferences and population structure // Theor Appl Genet. - 2003. - V. 106. - P. 1341 - 1352.Cipriani G., Lot G., Huang W.G., Marrazzo M.T., Peterlunger E., Testolin R. AC/GT and AG/CT microsatellite repeats in peach (Prunus persica (L) Batsch): isolation characterisation and cross-species amplification in Prunus // Theor Appl Genet. - 1999. - Vol. 99 - P. 65 - 72.Cipriani G., Lot G., Huang W.G., Marrazzo M.T., Peterlunger E., Testolin R. AC/GT and AG/CT microsatellite repeats in peach (Prunus persica (L) Batsch): isolation characterisation and cross-species amplification in Prunus // Theor Appl Genet. - 1999. - Vol. 99 - P. 65 - 72.Dirlewanger E., Graziano E., Joobeur T., Garriga-Calderé F., Cosson P., Howad W., Arús P. Comparative mapping and marker-assisted selection in Rosaceae fruit crops // Proc Natl Acad Sci USA. - 2004. - V. 101 - P. 9891 - 9896.Dirlewanger E., Graziano E., Joobeur T., Garriga-Calderé F., Cosson P., Howad W., Arús P. Comparative mapping and marker-assisted selection in Rosaceae fruit crops // Proc Natl Acad Sci USA. - 2004. - V. 101 - P. 9891 - 9896.Dirlewanger E., Cosson P., Tavaud M., Aranzana M. J., Poizat C., Zanetto A., Arús P., Laigret F. Development of microsatellite markers in peach (Prunus persica (L.) Batsch) and their use in genetic diversity analysis in peach and sweet cherry (Prunus avium L.) // Theor Appl Genet - 2002. - Vol. 105. - P. 127-138.Dirlewanger E., Cosson P., Tavaud M., Aranzana M. J., Poizat C., Zanetto A., Arús P., Laigret F. Development of microsatellite markers in peach (Prunus persica (L.) Batsch) and their use in genetic diversity analysis in peach and sweet cherry (Prunus avium L.) // Theor Appl Genet - 2002. - Vol. 105. - P. 127-138.Faust M., Timon B. Origin and dissemination of peach // Hortic Rev. - 1995. - V. 17. - C. 331 - 379.Faust M., Timon B. Origin and dissemination of peach // Hortic Rev. - 1995. - V. 17. - C. 331 - 379.Guarino C., Santoro S., De Simone L., Cipriani G. Prunus avium: nuclear DNA study in wild populations and sweet cherry cultivars // Genome. - 2009. - V. 52. - P. 320 -337.Guarino C., Santoro S., De Simone L., Cipriani G. Prunus avium: nuclear DNA study in wild populations and sweet cherry cultivars // Genome. - 2009. - V. 52. - P. 320 -337.Hammer, Ų., Harper, D.A.T., Ryan, P.D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica. - 2001.- 4 (1). - P. 9.Hammer, Ų., Harper, D.A.T., Ryan, P.D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica. - 2001.- 4 (1). - P. 9.Mnejja M., Garcia-Mas J., Audergon J-M., Arús P. Prunus microsatellite transferability across Rosaceae species // Tree Genet Genomes. - 2010. - V. 6. - P. 689 - 700.Mnejja M., Garcia-Mas J., Audergon J-M., Arús P. Prunus microsatellite transferability across Rosaceae species // Tree Genet Genomes. - 2010. - V. 6. - P. 689 - 700.Peakall, R. and Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update // Bioinformatics. - 2012. - 28. - P. 2537 - 2539.Peakall, R. and Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update // Bioinformatics. - 2012. - 28. - P. 2537 - 2539.Testolin R., Marrazzo T., Cipriani G., Quarta R., Verde I., Dettori M.T., Pancaldi M., Sansavini S. Microsatellite DNA in peach (Prunus persica L. Batsch) and its use in fingerprinting and testing the genetic origin of cultivars // Genome - 2000. - Vol. 43 - P. 512 - 520.Testolin R., Marrazzo T., Cipriani G., Quarta R., Verde I., Dettori M.T., Pancaldi M., Sansavini S. Microsatellite DNA in peach (Prunus persica L. Batsch) and its use in fingerprinting and testing the genetic origin of cultivars // Genome - 2000. - Vol. 43 - P. 512 - 520.Xie H., Sui Y., Chang F.Q., Xu Y., Ma R.C. SSR allelic variation in almond (Prunus dulcis Mill) // Theor Appl Genet. - 2006. - V. 112. - P. 366 - 372.Xie H., Sui Y., Chang F.Q., Xu Y., Ma R.C. SSR allelic variation in almond (Prunus dulcis Mill) // Theor Appl Genet. - 2006. - V. 112. - P. 366 - 372.Yoon J.H., Liu D.C., Song W.S., Liu W.S., Zhang A.M., Li S.H. Genetic diversity and ecogeographical phylogenetic relationships among peach and nectarine cultivars based on simple sequence repeat (SSR) markers // Amer Soc Hort Sci. - 2006. - Vol. 131 - P. 513-521.Yoon J.H., Liu D.C., Song W.S., Liu W.S., Zhang A.M., Li S.H. Genetic diversity and ecogeographical phylogenetic relationships among peach and nectarine cultivars based on simple sequence repeat (SSR) markers // Amer Soc Hort Sci. - 2006. - Vol. 131 - P. 513-521.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.