Дуб является одной из наиболее ценных лесных пород на всей Европейско-Уральской части России и имеет большое экономическое значение. К настоящему времени были разработаны серии SSR-маркеров, впоследствии успешно примененные для изучения генетической структуры популяций этого вида. Однако следует отметить, что отечественный генофонд дуба черешчатого еще недостаточно в полном объеме изучался с использованием современных молекулярно-генетических подходов. В нашем исследовании с применением микросателлитного анализа изучена генетическая изменчивость 25 SSR-локусов клонов дуба черечшатого из дубравы Шипов лес на лесосеменной плантации в Воронежской области. Как и предполагалось, все изучаемые SSR-локусы оказались эффективными по выявлению полиморфизма ДНК. Они обладали высоким коэффициентом полиморфизма, а также высоким показателем ожидаемой гетерозиготности (Не) - от 0,410 до 0,828. Из протестированных микросателлитных локусов для ядерной части ДНК (nSSRs) наиболее полиморфными оказались локусы ZAG4, ZAG5, ZAG7, ZAG39, ZAG65, ZAG75, ZAG87, ZAG110, ZAG112, а также локус PIE243 в транскрибируемой части ДНК (EST-SSRs). Для дуба черешчатого на клоновой ЛСП в целом выявлен более высокий уровень ожидаемой гетерозиготности (He) по сравнению с наблюдаемой (Ho), что указывает на дефицит гетерозигот относительно ожидаемого распределения по закону Харди-Вайнберга. Основные средние генетические параметры в дубраве «Шипов лес» составили: Не и Но равны соответственно 0,623 и 0,141, ne = 3,067, индекс фиксации Райта = 0,765. Полученные данные позволяют оценить особенности генетического разнообразия клонов дуба ценного лесного массива естественного происхождения на юге Воронежской области для рационального использования в практике лесовосстановления. Полученные параметры изменчивость дуба в Шиповом лесу по молекулярным маркерам оказались чуть ниже, чем у популяций дуба из краевых популяций Южно-Уральского региона, но несколько выше, чем у дуба в Республике Марий Эл, Беларуси.
Oak is one of the most valuable forest species throughout the European-Ural part of Russia and is of great economic importance. To date, a series of SSR markers have been developed, which were subsequently successfully applied to study the genetic structure of populations of this species. However, it should be noted that the domestic gene pool of English oak has not yet been studied in full using modern molecular genetic approaches. In our study, using microsatellite analysis, we studied the genetic variability of 25 SSR loci in English oak clones from the "Shipov Les" oak forest on a forest seed plantation in the Voronezh region. As expected, all studied SSR loci were effective in detecting DNA polymorphism. They had a high coefficient of polymorphism, as well as a high indicator of expected heterozygosity (He) - from 0.410 to 0.828. Of the tested microsatellite loci for the nuclear part of DNA (nSSRs), the most polymorphic loci were ZAG4, ZAG5, ZAG7, ZAG39, ZAG65, ZAG75, ZAG87, ZAG110, ZAG112, as well as the PIE243 locus in the transcribed part of DNA (EST-SSRs). For pedunculate oak on clonal LSP, in general, a higher level of expected heterozygosity (He) compared to observed (Ho) was revealed, which indicates a deficit of heterozygotes relative to the expected distribution according to the Hardy-Weinberg law. The main average genetic parameters in the oak forest "Shipov Les" were: He and Ho equal to 0.623 and 0.141, respectively, ne = 3.067, fixation index F = 0.765. The data obtained make it possible to evaluate the features of the genetic diversity of clones of a valuable forest massif of natural origin in the south of the Voronezh region for rational use in reforestation practice. The obtained parameters of the variability of oak in the "Shipov Les" by molecular markers turned out to be slightly lower than in oak populations from the marginal populations of the South Ural region, but slightly higher than in oak in the Republic of Mari El, Belarus.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.