ВЛИЯНИЕ ПОЛИМОРФИЗМА SSR-ЛОКУСОВ НА ПОКАЗАТЕЛИ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИЗМЕНЧИВОСТИ У ПОПУЛЯЦИИ PINUSSYLVESTRIS L. В СТЕПНОЙ ЗОНЕ ЕВРОПЕЙСКОЙ РОССИИ

В данном исследовании мы сравнили разные варианты оценки влияния полиморфизма SSR-локусов на показатели аллельной и генетической изменчивости в популяции сосны обыкновенной ( Pinus sylvestris L.). Для исследования влияния полиморфизма SSR-локусов на оценки изучаемых параметров аллельного и генетического полиморфизма они были разбиты на 3 группы: общая выборка, состоящая из 14 EST-SSRs и 4 nSSRs локусов (первая группа локусов), выборка из 13 EST-SSRs и 4 nSSRs, исключающая 1 мономорфный локус (вторая группа локусов) и выборка из 7 EST-SSRs и 2 nSSRs, исключающая локусы, выявившие по 2 аллельных варианта на локус (третья группа). Получены сходные средние оценки аллельной и генетической дифференциации, вычисленные с использованием 18 и 17 EST-SSRs и nSSRs локусов из первой и второй группы: показатель А составил - 3,500 и 3,647, Не - 2,464 и 2,550 соответственно. В тоже время, анализ параметров аллельного разнообразия образцов сосны из изучаемой популяции показал максимальный уровень полиморфности по 7 EST-SSRs и 2 nSSRs локусам, выявивших в исследовании от 3 аллельных вариантов и более (показатель А составил 5,111, Не - 3,308). Сходная тенденция в увеличении показателей генетического разнообразия выявлена также для этой группы локусов: показатель ожидаемой гетерозиготности (H_е) равен 0,635. Полученные результаты на примере популяции сосны обыкновенной показывают, что значения аллельного разнообразия напрямую зависят от полиморфности локусов, использованных в исследовании. В связи с этим, для мониторинга состояния генетических ресурсов хозяйственно-ценных древесных пород с применением методов анализа ДНК, на наш взгляд, он должен включать в себя единую панель микросателлитных локусов, с которыми будет работать исследователь при изучении всех выборок в данном регионе или лесосеменном районе для уменьшения ошибки при расчете показателей генетической структуры.

Pinus sylvestris L, полиморфизм, микросателлитные локусы, аллельное разнообразие, генетическое разнообразие

1. Галинская Т.В., Щепетов Д.М., Лысенков С.Н. Предубеждения о микросателлитных исследованиях и как им противостоять // Генетика. - 2019. - Т 55. - №6. - С. 1-16.

2. Калько Г.В. Тестирование ядерных микросателлитных маркеров сосны обыкновенной // Труды Санкт-Петербургского научно-исследовательского института лесного хозяйства. - 2017. - № 1. - С.23-34.

3. Крутовский К.В. От популяционной генетики к популяционной геномике лесных древесных видов: интегрированный популяционно-геномный подход // Генетика. - 2006. - Т. 42. - № 10. - С. 1088-1100.

4. Крутовский К.В. Перспективы использования геномных исследований в лесном хозяйстве // Сибирский лесной журнал. - 2014. - № 4. - С. 11-15.

5. Петюренко М.Ю., Камалова И.И., Сердюкова А.П. Экстракция суммарной ДНК из Pinus sylvestris L. при оценке полиморфизма с использованием SSR- и RAPD-маркеров // Труды Санкт-Петербургского научно-исследовательского института лесного хозяйства. - 2021. - № 3. - С. 13-25.

6. Тихонова И.В., Семериков В.Л., Семерикова С.А., Дымшакова О.С., Зацепина К.Г. О выборках в исследованиях внутривидового генетического разнообразия сосны обыкновенной // Сибирский лесной журнал. - 2014. - № 4. - С. 99-109.

7. Торбик Д.Н., Бедрицкая Т.В., Власова М.М., Синельников И.Г. Генетическое разнообразие естественных популяций Pinus sylvestris // Наука - лесному хозяйству Севера: сборник научных трудов ФБУ «СевНИИЛХ». Отв. ред. Н.А. Демидова. - Архангельск. - 2019. - С. 91-99.

8. Auckland L., Bui T., Zhou Y., Shepherd M., Williams C. Conifer Microsatellite Handbook. - Texas: A & M University, College Station. - 2002. - 57 p.

9. Fang P., Niu S., Yuan H., Li Z., Zhang Y., Yuan L., Li W. Development and characterization of 25 EST-SSR markers in Pinus sylvestris var. mongolica (Pinaceae) // Applications in Plant Sciences. - 2014. - № 2. - P. 1-6.

10. Soranzo N., Provan J., Powell W. Characterization of microsatellite loci in Pinus sylvestris L. // Molecular Ecology. - 1998. - No. 7(9). - P. 1260-1261.