ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ДЛЯ ДНК - ПАСПОРТИЗАЦИИ И ИЗУЧЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ВЗАИМОСВЯЗЕЙ СОРТОВ ПЕРСИКА, БЛИЗКИХ ПО ПРОИСХОЖДЕНИЮ
https://doi.org/10.25684/NBG.boolt.130.2019.13
Аннотация
Приведены результаты анализа полиморфизма 18 микросателлитных маркеров на выборке из 19 сортов персика, включающей несколько групп сортов, близких по происхождению. Маркеры показали уровень полиморфизма от 2 (маркеры BPPCT028 и UDP98-409) до 7 аллелей (маркер EMPaS01) на локус. Аллельный набор по трем наиболее полиморфным маркерам сформировал уникальные фингерпринты для каждого из изученных сортов, несмотря на общность по происхождению для многих сортов. Результаты кластерного анализа выявили закономерности при распределении по кластерам, согласующиеся с происхождением сортов.
Об авторах
Иван Иванович Супрун
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
Россия
Россия
Анатолий Владимирович Смыков
Никитский ботанический сад - Национальный научный центр РАН
Россия
Россия
Илья Владимирович Степанов
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
Россия
Россия
Список литературы
1. Плугатарь Ю.В., Бабина Р.Д., Супрун И.И., Науменко Т.С., Алексеев Я.И. Оценка сортов груши, выделенных из генофондовой коллекции Никитского ботанического сада по комплексу хозяйственно ценных признаков, с помощью микросателлитных маркеров // Вавиловский журнал генетики и селекции - 2018. - 22 (1) - С. 60-68 DOI 10.18699 / VJ 18.332/.
2. Смыков А.В., Федорова О.С., Шишова Т.В., Иващенко Ю.А. Селекция персика и ее результаты в Никитском ботаническом саду // Сборник научных трудов ГНБС. - 2015. - Т. 140. - С. 23 - 33.
3. Супрун И.И., Смыков А.В., Токмаков С.В. SSR-фингерпринтинг и оценка генетических взаимосвязей сортов персика современной селекции Никитского ботанического сада // Садоводство и виноградарство. - 2017. - № 5. - С. 23 - 27.
4. Супрун И.И., Токмаков С.В., Степанов И.В., Балапанов И.М. Разработка мультиплексных наборов SSR-маркеров для использования в изучении генетического разнообразия в пределах родов Malus, Prunus и Pyrus // Научные труды ГНУ СКЗНИИСиВ «Методологическое обеспечение селекции садовых культур и винограда на современном этапе», 2013. - Т. 1. - С. 97 - 101.
5. Aranzana M.J., Carbó J., Arús P. Microsatellite variability in peach (Prunus persica (L.) Batsch): cultivar identification marker mutation pedigree inferences and population structure // Theor Appl Genet. - 2003. - V. 106. - P. 1341 - 1352.
6. Cipriani G., Lot G., Huang W.G., Marrazzo M.T., Peterlunger E., Testolin R. AC/GT and AG/CT microsatellite repeats in peach (Prunus persica (L) Batsch): isolation characterisation and cross-species amplification in Prunus // Theor Appl Genet. - 1999. - Vol. 99 - P. 65 - 72.
7. Dirlewanger E., Graziano E., Joobeur T., Garriga-Calderé F., Cosson P., Howad W., Arús P. Comparative mapping and marker-assisted selection in Rosaceae fruit crops // Proc Natl Acad Sci USA. - 2004. - V. 101 - P. 9891 - 9896.
8. Dirlewanger E., Cosson P., Tavaud M., Aranzana M. J., Poizat C., Zanetto A., Arús P., Laigret F. Development of microsatellite markers in peach (Prunus persica (L.) Batsch) and their use in genetic diversity analysis in peach and sweet cherry (Prunus avium L.) // Theor Appl Genet - 2002. - Vol. 105. - P. 127-138.
9. Faust M., Timon B. Origin and dissemination of peach // Hortic Rev. - 1995. - V. 17. - C. 331 - 379.
10. Guarino C., Santoro S., De Simone L., Cipriani G. Prunus avium: nuclear DNA study in wild populations and sweet cherry cultivars // Genome. - 2009. - V. 52. - P. 320 -337.
11. Hammer, Ų., Harper, D.A.T., Ryan, P.D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica. - 2001.- 4 (1). - P. 9.
12. Mnejja M., Garcia-Mas J., Audergon J-M., Arús P. Prunus microsatellite transferability across Rosaceae species // Tree Genet Genomes. - 2010. - V. 6. - P. 689 - 700.
13. Peakall, R. and Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update // Bioinformatics. - 2012. - 28. - P. 2537 - 2539.
14. Testolin R., Marrazzo T., Cipriani G., Quarta R., Verde I., Dettori M.T., Pancaldi M., Sansavini S. Microsatellite DNA in peach (Prunus persica L. Batsch) and its use in fingerprinting and testing the genetic origin of cultivars // Genome - 2000. - Vol. 43 - P. 512 - 520.
15. Xie H., Sui Y., Chang F.Q., Xu Y., Ma R.C. SSR allelic variation in almond (Prunus dulcis Mill) // Theor Appl Genet. - 2006. - V. 112. - P. 366 - 372.
16. Yoon J.H., Liu D.C., Song W.S., Liu W.S., Zhang A.M., Li S.H. Genetic diversity and ecogeographical phylogenetic relationships among peach and nectarine cultivars based on simple sequence repeat (SSR) markers // Amer Soc Hort Sci. - 2006. - Vol. 131 - P. 513-521.
Рецензия
Для цитирования:
Супрун И.И., Смыков А.В., Степанов И.В. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ДЛЯ ДНК - ПАСПОРТИЗАЦИИ И ИЗУЧЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ВЗАИМОСВЯЗЕЙ СОРТОВ ПЕРСИКА, БЛИЗКИХ ПО ПРОИСХОЖДЕНИЮ. Бюллетень Государственного Никитского ботанического сада. 2019;(130):99-107. https://doi.org/10.25684/NBG.boolt.130.2019.13
For citation:
Suprun I.I., Smykov A.V., Stepanov I.V. Use of microsatellite markers for DNA passportization and study of genetic relations of cultivars of peach that are similar in origin. Bulletin of the State Nikitsky Botanical Gardens. 2019;(130):99-107. (In Russ.) https://doi.org/10.25684/NBG.boolt.130.2019.13
Просмотров:
184
Послать статью по эл. почте 