Species composition and prevalence of viruses in stone fruits plantations in the European part of the Russian Federation
https://doi.org/10.25684/0513-1634-2024-150-63-68
Abstract
In the framework of scientific monitoring conducted by the All-Russian Centre of Plant Quarantine (VNIIKR), the following viruses were tested by ELISA on samples of stone fruit crops collected on the territory of 20 regions of the Russian Federation: ACLSV, ApMV, APLPV, ArMV, CLRV, CRLV, PBNSPaV, PDV, PNRSV, PPV, PRMV, RpRSV, SLRSV, TBRV, ToRSV and TRSV. The spread of plum pox potyvirus (PPV), prunus necrotic ring spot ilarvirus (PNRSV) and prune dwarf ilarvirus (PDV) were found in 12, 12, and 8 regions of the Russian Federation, respectively, in 14.9%, 11.9% and 1.7% of test samples. The presence of these viruses was confirmed by polymerase chain reaction followed by sequencing. An analysis of the occurrence of these viruses depending on the type of plantations, plant species, and geographic region was performed.
About the Authors
Yu. N. Prikhodko
Всероссийский центр карантина растений (ФГБУ ВНИИКР)
Russian Federation
Russian Federation
T. S. Zhivaeva
Всероссийский центр карантина растений (ФГБУ ВНИИКР)
Russian Federation
Russian Federation
Y. A. Shneyder
Всероссийский центр карантина растений (ФГБУ ВНИИКР)
Russian Federation
Russian Federation
M. O. Kondratiev
Всероссийский центр карантина растений (ФГБУ ВНИИКР)
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Приходько Ю.Н., Магомедов У.Ш. Вирусы семечковых и косточковых плодовых культур // Воронеж: «Научная книга». – 2011. – 468 с.
2. Приходько Ю.Н., Мазурин Е.С., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А., Соколова Е.Е. Изучение штаммов вируса шарки сливы // Защита и карантин растений. – 2011. – № 11. – С. 29-32.
3. Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А., Морозова О.Н., Мазурин Е.С. Выявление в Российской Федерации нового штамма вируса шарки слив – CherryRussian (CR) // Карантин растений. Наука и практика. – 2013. – № 2(4). – C. 18-33.
4. Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А., Морозова О.Н. Распространенность, диагностика и штаммовый состав вируса шарки слив (PPV) // Фитосанитарная оптимизация агроэкосистем / Материалы III Всероссийского съезда по защите растений. – Санкт-Петербург. – 2013. – Т.1. – С. 265-268
5. Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А. Скрининговые методы выявления комплекса штаммов вируса шарки слив (PPV) // Садоводство и виноградарство. – 2019. – № 1 – С. 36-42.
6. Чирков С.К., Приходько Ю.Н. Генетическое разнообразие и структура популяции вируса оспы (шарки) сливы в России // Сельскохозяйственная Биология. – 2015. – Т. 50, № 5. – С. 529-539
7. Chirkov S., Ivanov P., Sheveleva A., Kudryavtseva F., Prikhodko Y., Mitrofanova I. Occurrence and characterization of plum pox virus strain D isolates from European Russia and Crimea // Arch. Virol. – 2016. – Vol. 161. – P.425-430.
8. EPPO, 2023. EPPO Global Database. – [Electronic resource] – URL: https://gd.eppo.int.
9. Glasa M., Prikhodko Y., Predajňa L., Nagyová A., Shneyder Y., Zhivaeva T., Šubr Z., Cambra M., Candresse T. Characterization of sour cherry isolates of Plum pox virus from the Volga Basin in Russia reveals a new cherry strain of the virus // Phytopathology. – 2013. – Vol.103, № 9. – Р. 972-979.
10. Marbot S., Salmon M., Vendrame M., Huwaert A., Kummert J., Dutrecq O., and Lepoivre P. Development of real-time RT-PCR assay for detection of Prunus necrotic ringspot virus in fruit trees // Plant Disease. – 2003. – Vol.87. – P.1344-1348.
11. Prikhodko Yu., Shneider Yu., Zhivaeva T., Morozova O. The PPV-W strain in Russia: distribution and identification // Book of Abstracts 3rd International Symposium on Plum pox virus. – Antalya – Turkey, 9-13 May 2016. – P.45-46.
12. Rowhani A., Biardi L., Routh G., Daubert S.D., Golino D.A. Development of a sensitive colorimetric-PCR assay for detection of viruses in woody plants // Plant Disease. – 1998. – Vol. 82. – P. 880-884.
Review
For citations:
Prikhodko Yu.N., Zhivaeva T.S., Shneyder Y.A., Kondratiev M.O. Species composition and prevalence of viruses in stone fruits plantations in the European part of the Russian Federation. Bulletin of the State Nikitsky Botanical Gardens. 2024;(150):63-68. (In Russ.) https://doi.org/10.25684/0513-1634-2024-150-63-68
Views:
340
Email this article 